Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm10Q3UTQ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm10Q3UTQ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm10Q3UTQ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm10Q3UTQ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm10Q3UTQ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm10Q3UTQ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm10Q3UTQ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm10Q3UTQ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm10Q3UTQ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm10Q3UTQ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm10Q3UTQ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Prdm10Q3UTQ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms