Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain3Q3URJ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkain3Q3URJ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms