Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Babam1Q3UI43 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Babam1Q3UI43 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Babam1Q3UI43 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Babam1Q3UI43 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Babam1Q3UI43 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Babam1Q3UI43 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Babam1Q3UI43 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Babam1Q3UI43 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Babam1Q3UI43 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Babam1Q3UI43 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Babam1Q3UI43 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Babam1Q3UI43 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Babam1Q3UI43 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Babam1Q3UI43 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms