Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brf2Q3UAW9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brf2Q3UAW9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms