Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim43aQ3TL54 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms