Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2f1Q3THK3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2f1Q3THK3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2f1Q3THK3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms