Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDRF1Q3B7T1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDRF1Q3B7T1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDRF1Q3B7T1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms