Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd11Q1RNF8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd11Q1RNF8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd11Q1RNF8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms