Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NCOA1Q15788 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
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