Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.423e-10■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 222.69■■□□□ 1.223e-10■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 412.73□□□□□ -0.373e-10■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 CDK2AP2-202ENST00000525402 1692 ntTSL 220.26■□□□□ 0.832e-19■■■■■ 32.5
PCBP1Q15365 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.792e-19■■■■■ 32.5
PCBP1Q15365 CDK2AP2-204ENST00000531178 923 ntTSL 1 (best)16.78■□□□□ 0.282e-19■■■■■ 32.5
PCBP1Q15365 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.269e-7■■■■■ 32.5
PCBP1Q15365 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 32.5
PCBP1Q15365 AC068580.4-204ENST00000427721 1007 ntTSL 217.8■□□□□ 0.441e-9■■■■■ 32.5
PCBP1Q15365 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.842e-6■■■■■ 32.5
PCBP1Q15365 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 32.5
PCBP1Q15365 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 32.5
PCBP1Q15365 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 32.5
PCBP1Q15365 RNASEK-208ENST00000570898 425 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.546e-10■■■■■ 32.4
PCBP1Q15365 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.275e-14■■■■■ 32.4
PCBP1Q15365 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 514.39□□□□□ -0.115e-14■■■■■ 32.4
PCBP1Q15365 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.035e-14■■■■■ 32.4
PCBP1Q15365 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 45.47□□□□□ -1.535e-14■■■■■ 32.4
PCBP1Q15365 SORBS3-203ENST00000517535 3067 ntTSL 220■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 32.3
PCBP1Q15365 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.176e-10■■■■■ 32.2
PCBP1Q15365 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.76e-10■■■■■ 32.2
PCBP1Q15365 MIR6751-201ENST00000610479 63 ntBASIC9.22□□□□□ -0.931e-14■■■■■ 32.2
PCBP1Q15365 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.475e-21■■■■■ 32.1
PCBP1Q15365 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.435e-21■■■■■ 32.1
PCBP1Q15365 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.275e-21■■■■■ 32.1
PCBP1Q15365 AP2S1-208ENST00000600964 458 ntTSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.855e-21■■■■■ 32.1
PCBP1Q15365 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.775e-21■■■■■ 32.1
PCBP1Q15365 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.775e-21■■■■■ 32.1
PCBP1Q15365 AP2S1-209ENST00000601498 898 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.255e-21■■■■■ 32.1
PCBP1Q15365 AP2S1-206ENST00000598027 355 ntTSL 27.32□□□□□ -1.245e-21■■■■■ 32.1
PCBP1Q15365 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.355e-21■■■■■ 32.1
PCBP1Q15365 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 32
PCBP1Q15365 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 32
PCBP1Q15365 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 32
PCBP1Q15365 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.077e-8■■■■■ 32
PCBP1Q15365 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-235ENST00000527719 750 ntTSL 521.1■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-230ENST00000526332 579 ntTSL 420.97■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-218ENST00000488042 1134 ntTSL 219.76■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-237ENST00000530031 800 ntTSL 519.4■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-207ENST00000434694 1056 ntTSL 519.21■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-232ENST00000526904 551 ntTSL 418.61■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-277ENST00000626852 511 ntTSL 518.17■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-243ENST00000532772 1618 ntTSL 517.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-206ENST00000430786 849 ntTSL 516.87■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-236ENST00000528879 1524 ntTSL 516.76■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-201ENST00000323275 2450 ntTSL 1 (best)16.31■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-210ENST00000458452 2571 ntTSL 215.43■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-229ENST00000526113 591 ntTSL 515.33■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 INTS11-233ENST00000527098 2004 ntTSL 215.09■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 31.9
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PCBP1Q15365 INTS11-231ENST00000526797 659 ntTSL 413.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 31.9
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PCBP1Q15365 LINC00969-220ENST00000455807 764 ntTSL 313.12□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-286ENST00000627297 708 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 31.9
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PCBP1Q15365 LINC00969-227ENST00000595086 704 ntTSL 512.72□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 31.9
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PCBP1Q15365 LINC00969-255ENST00000625383 612 ntTSL 511.54□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-329ENST00000630675 608 ntTSL 511.42□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-333ENST00000631037 451 ntTSL 511.42□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-298ENST00000627863 793 ntTSL 511.42□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-299ENST00000627993 633 ntTSL 511.33□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-314ENST00000628982 554 ntTSL 511.31□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-209ENST00000432194 503 ntTSL 511.12□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 31.9
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PCBP1Q15365 LINC00969-256ENST00000625531 468 ntTSL 510.66□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-282ENST00000626979 698 ntTSL 510.43□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-234ENST00000597982 579 ntTSL 510.36□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-280ENST00000626904 598 ntTSL 510.36□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-318ENST00000629721 755 ntTSL 510.36□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-232ENST00000597662 570 ntTSL 510.36□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-326ENST00000630415 560 ntTSL 510.36□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-270ENST00000626346 652 ntTSL 510.36□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-239ENST00000600288 728 ntTSL 510.36□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-249ENST00000615212 473 ntTSL 510.36□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-248ENST00000612098 592 ntTSL 510.35□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-284ENST00000627035 458 ntTSL 59.93□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-238ENST00000600197 1090 ntTSL 59.93□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-289ENST00000627471 851 ntTSL 59.85□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-339ENST00000631345 507 ntTSL 59.57□□□□□ -0.885e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-222ENST00000593988 1072 ntTSL 59.52□□□□□ -0.895e-7■■■■■ 31.9
PCBP1Q15365 LINC00969-233ENST00000597871 839 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.895e-7■■■■■ 31.9
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