Protein–RNA interactions for Protein: Q14C37

Lemd1, LEM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd1Q14C37 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lemd1Q14C37 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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Lemd1Q14C37 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lemd1Q14C37 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms