Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ptchd1Q14B62 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ptchd1Q14B62 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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