Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSHL1Q14406 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSHL1Q14406 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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