Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGCGQ13326 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCGQ13326 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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