Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALCOCO2Q13137 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALCOCO2Q13137 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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