Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF3Q13114 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF3Q13114 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TRAF3Q13114 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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TRAF3Q13114 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TRAF3Q13114 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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TRAF3Q13114 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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TRAF3Q13114 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3Q13114 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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