Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NFIAQ12857 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFIAQ12857 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIAQ12857 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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