Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5aQ0V8T9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntnap5aQ0V8T9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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