Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cib3Q0P523 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.1 ms