Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Col17a1Q07563 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Col17a1Q07563 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Col17a1Q07563 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Col17a1Q07563 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms