Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sdr16c6Q05A13 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sdr16c6Q05A13 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sdr16c6Q05A13 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sdr16c6Q05A13 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sdr16c6Q05A13 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sdr16c6Q05A13 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sdr16c6Q05A13 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sdr16c6Q05A13 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sdr16c6Q05A13 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sdr16c6Q05A13 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sdr16c6Q05A13 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sdr16c6Q05A13 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms