Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r236Q05A06 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r236Q05A06 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r236Q05A06 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms