Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNEQ04844 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms