Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crisp3Q03402 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crisp3Q03402 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crisp3Q03402 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms