Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha4Q03137 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha4Q03137 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms