Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCEQ02156 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCEQ02156 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCEQ02156 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms