Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ascl1Q02067 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ascl1Q02067 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms