Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp10Q000W5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbp10Q000W5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms