Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM3AP98173 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM3AP98173 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms