Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP4F2P78329 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYP4F2P78329 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms