Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB1P62873 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNB1P62873 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNB1P62873 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNB1P62873 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB1P62873 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB1P62873 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB1P62873 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB1P62873 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB1P62873 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB1P62873 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB1P62873 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB1P62873 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB1P62873 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB1P62873 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB1P62873 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB1P62873 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB1P62873 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB1P62873 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB1P62873 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB1P62873 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB1P62873 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB1P62873 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB1P62873 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB1P62873 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB1P62873 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB1P62873 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB1P62873 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GNB1P62873 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GNB1P62873 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB1P62873 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB1P62873 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB1P62873 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB1P62873 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB1P62873 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB1P62873 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB1P62873 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB1P62873 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB1P62873 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB1P62873 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GNB1P62873 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB1P62873 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB1P62873 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB1P62873 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB1P62873 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB1P62873 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB1P62873 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB1P62873 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GNB1P62873 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms