Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm2aP59997 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm2aP59997 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kdm2aP59997 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm2aP59997 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms