Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc1a3P56564 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc1a3P56564 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms