Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PltpP55065 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PltpP55065 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PltpP55065 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PltpP55065 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PltpP55065 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PltpP55065 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PltpP55065 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PltpP55065 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PltpP55065 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PltpP55065 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PltpP55065 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PltpP55065 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PltpP55065 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PltpP55065 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PltpP55065 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PltpP55065 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PltpP55065 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PltpP55065 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PltpP55065 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PltpP55065 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PltpP55065 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PltpP55065 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PltpP55065 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PltpP55065 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PltpP55065 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PltpP55065 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PltpP55065 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PltpP55065 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PltpP55065 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PltpP55065 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PltpP55065 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PltpP55065 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PltpP55065 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PltpP55065 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PltpP55065 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PltpP55065 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PltpP55065 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PltpP55065 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PltpP55065 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PltpP55065 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PltpP55065 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PltpP55065 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PltpP55065 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PltpP55065 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PltpP55065 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PltpP55065 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PltpP55065 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PltpP55065 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PltpP55065 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PltpP55065 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PltpP55065 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PltpP55065 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PltpP55065 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PltpP55065 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PltpP55065 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PltpP55065 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PltpP55065 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PltpP55065 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PltpP55065 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PltpP55065 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PltpP55065 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PltpP55065 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PltpP55065 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PltpP55065 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PltpP55065 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PltpP55065 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PltpP55065 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PltpP55065 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PltpP55065 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PltpP55065 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PltpP55065 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PltpP55065 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PltpP55065 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PltpP55065 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PltpP55065 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PltpP55065 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PltpP55065 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PltpP55065 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PltpP55065 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PltpP55065 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PltpP55065 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PltpP55065 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PltpP55065 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PltpP55065 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PltpP55065 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PltpP55065 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms