Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CRYBA4P53673 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRYBA4P53673 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRYBA4P53673 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms