Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP11P51784 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP11P51784 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP11P51784 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP11P51784 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP11P51784 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP11P51784 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP11P51784 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP11P51784 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP11P51784 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP11P51784 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP11P51784 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP11P51784 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP11P51784 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP11P51784 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP11P51784 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP11P51784 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP11P51784 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP11P51784 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP11P51784 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP11P51784 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP11P51784 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP11P51784 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP11P51784 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP11P51784 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP11P51784 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP11P51784 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP11P51784 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP11P51784 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP11P51784 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP11P51784 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP11P51784 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP11P51784 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP11P51784 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP11P51784 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP11P51784 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP11P51784 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP11P51784 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP11P51784 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP11P51784 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP11P51784 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP11P51784 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP11P51784 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP11P51784 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP11P51784 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP11P51784 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP11P51784 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP11P51784 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP11P51784 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP11P51784 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP11P51784 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP11P51784 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP11P51784 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP11P51784 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP11P51784 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP11P51784 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP11P51784 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP11P51784 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP11P51784 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP11P51784 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP11P51784 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP11P51784 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP11P51784 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP11P51784 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP11P51784 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP11P51784 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP11P51784 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP11P51784 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP11P51784 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP11P51784 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP11P51784 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP11P51784 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP11P51784 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP11P51784 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP11P51784 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP11P51784 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP11P51784 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP11P51784 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP11P51784 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP11P51784 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP11P51784 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP11P51784 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP11P51784 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP11P51784 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP11P51784 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP11P51784 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP11P51784 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP11P51784 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP11P51784 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP11P51784 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP11P51784 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP11P51784 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP11P51784 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP11P51784 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP11P51784 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP11P51784 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP11P51784 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP11P51784 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP11P51784 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP11P51784 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms