Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psen1P49769 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Psen1P49769 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psen1P49769 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psen1P49769 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psen1P49769 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psen1P49769 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psen1P49769 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psen1P49769 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psen1P49769 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms