Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox2P48432 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox2P48432 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox2P48432 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox2P48432 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms