Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKI67P46013 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKI67P46013 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKI67P46013 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKI67P46013 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKI67P46013 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKI67P46013 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKI67P46013 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKI67P46013 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKI67P46013 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKI67P46013 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKI67P46013 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKI67P46013 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKI67P46013 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKI67P46013 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKI67P46013 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKI67P46013 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKI67P46013 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKI67P46013 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKI67P46013 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKI67P46013 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MKI67P46013 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MKI67P46013 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MKI67P46013 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MKI67P46013 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MKI67P46013 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MKI67P46013 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MKI67P46013 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKI67P46013 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKI67P46013 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKI67P46013 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MKI67P46013 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKI67P46013 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKI67P46013 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKI67P46013 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKI67P46013 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKI67P46013 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MKI67P46013 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKI67P46013 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKI67P46013 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKI67P46013 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKI67P46013 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MKI67P46013 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKI67P46013 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MKI67P46013 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKI67P46013 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKI67P46013 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKI67P46013 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKI67P46013 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKI67P46013 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKI67P46013 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKI67P46013 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MKI67P46013 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKI67P46013 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKI67P46013 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKI67P46013 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKI67P46013 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKI67P46013 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKI67P46013 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKI67P46013 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKI67P46013 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MKI67P46013 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKI67P46013 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKI67P46013 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKI67P46013 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKI67P46013 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKI67P46013 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKI67P46013 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKI67P46013 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKI67P46013 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MKI67P46013 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MKI67P46013 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MKI67P46013 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKI67P46013 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKI67P46013 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKI67P46013 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKI67P46013 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MKI67P46013 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKI67P46013 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MKI67P46013 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKI67P46013 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKI67P46013 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKI67P46013 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKI67P46013 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKI67P46013 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKI67P46013 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKI67P46013 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms