Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.7 ms