Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOLR3P41439 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOLR3P41439 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOLR3P41439 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOLR3P41439 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOLR3P41439 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOLR3P41439 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOLR3P41439 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOLR3P41439 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOLR3P41439 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOLR3P41439 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOLR3P41439 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOLR3P41439 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOLR3P41439 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOLR3P41439 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms