Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Chd1P40201 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Chd1P40201 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Chd1P40201 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Chd1P40201 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Chd1P40201 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Chd1P40201 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Chd1P40201 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Chd1P40201 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Chd1P40201 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Chd1P40201 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Chd1P40201 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Chd1P40201 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Chd1P40201 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Chd1P40201 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Chd1P40201 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Chd1P40201 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Chd1P40201 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Chd1P40201 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Chd1P40201 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Chd1P40201 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Chd1P40201 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Chd1P40201 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Chd1P40201 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Chd1P40201 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Chd1P40201 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Chd1P40201 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Chd1P40201 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms