Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk2P38575 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Upk2P38575 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk2P38575 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk2P38575 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk2P38575 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk2P38575 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk2P38575 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Upk2P38575 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms