Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acvr1P37172 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acvr1P37172 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acvr1P37172 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acvr1P37172 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acvr1P37172 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acvr1P37172 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acvr1P37172 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms