Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PpardP35396 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpardP35396 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpardP35396 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpardP35396 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpardP35396 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PpardP35396 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpardP35396 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpardP35396 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpardP35396 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpardP35396 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PpardP35396 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpardP35396 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PpardP35396 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PpardP35396 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PpardP35396 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PpardP35396 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PpardP35396 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PpardP35396 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PpardP35396 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PpardP35396 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PpardP35396 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpardP35396 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpardP35396 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpardP35396 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpardP35396 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpardP35396 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpardP35396 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpardP35396 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpardP35396 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PpardP35396 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PpardP35396 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PpardP35396 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PpardP35396 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PpardP35396 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PpardP35396 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PpardP35396 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PpardP35396 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PpardP35396 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PpardP35396 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PpardP35396 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PpardP35396 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PpardP35396 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PpardP35396 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PpardP35396 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PpardP35396 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PpardP35396 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PpardP35396 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PpardP35396 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PpardP35396 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PpardP35396 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PpardP35396 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PpardP35396 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PpardP35396 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PpardP35396 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PpardP35396 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpardP35396 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpardP35396 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpardP35396 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpardP35396 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PpardP35396 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpardP35396 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PpardP35396 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpardP35396 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PpardP35396 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpardP35396 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PpardP35396 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpardP35396 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpardP35396 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpardP35396 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpardP35396 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpardP35396 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpardP35396 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpardP35396 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PpardP35396 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PpardP35396 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms