Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SsbP32067 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SsbP32067 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SsbP32067 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SsbP32067 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SsbP32067 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SsbP32067 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SsbP32067 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SsbP32067 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SsbP32067 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SsbP32067 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SsbP32067 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SsbP32067 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SsbP32067 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SsbP32067 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SsbP32067 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SsbP32067 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SsbP32067 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SsbP32067 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SsbP32067 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SsbP32067 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SsbP32067 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SsbP32067 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SsbP32067 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SsbP32067 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SsbP32067 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SsbP32067 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SsbP32067 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SsbP32067 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SsbP32067 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SsbP32067 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SsbP32067 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SsbP32067 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SsbP32067 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SsbP32067 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SsbP32067 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SsbP32067 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SsbP32067 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SsbP32067 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SsbP32067 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SsbP32067 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SsbP32067 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SsbP32067 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SsbP32067 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SsbP32067 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SsbP32067 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SsbP32067 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SsbP32067 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SsbP32067 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SsbP32067 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SsbP32067 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SsbP32067 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SsbP32067 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SsbP32067 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SsbP32067 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SsbP32067 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SsbP32067 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SsbP32067 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SsbP32067 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SsbP32067 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SsbP32067 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SsbP32067 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SsbP32067 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SsbP32067 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SsbP32067 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SsbP32067 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SsbP32067 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SsbP32067 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SsbP32067 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SsbP32067 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SsbP32067 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SsbP32067 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SsbP32067 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SsbP32067 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SsbP32067 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SsbP32067 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SsbP32067 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SsbP32067 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SsbP32067 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SsbP32067 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SsbP32067 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SsbP32067 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SsbP32067 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SsbP32067 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SsbP32067 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SsbP32067 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SsbP32067 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SsbP32067 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SsbP32067 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SsbP32067 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SsbP32067 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SsbP32067 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SsbP32067 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SsbP32067 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SsbP32067 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SsbP32067 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SsbP32067 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SsbP32067 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SsbP32067 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SsbP32067 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms