Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp1P29452 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casp1P29452 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp1P29452 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp1P29452 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp1P29452 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp1P29452 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp1P29452 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp1P29452 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp1P29452 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp1P29452 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp1P29452 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp1P29452 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.8 ms