Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psmb9P28076 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb9P28076 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms