Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh3P13705 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh3P13705 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh3P13705 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh3P13705 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh3P13705 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh3P13705 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh3P13705 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msh3P13705 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msh3P13705 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msh3P13705 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.5 ms