Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZNF35P13682 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF35P13682 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms